唯美之恋 发表于 2018-11-21 11:42:46

第一性原理分子动力学热力学积分求非谐自由能

最近投了一篇文章,审稿人要求用准谐近似并加非谐自由能校正计算ThO2的热力学性质,我看了一些文献,关于热力学性质非谐自由能的计算大多数都是采用热力学积分(Thermodynamic Integration)来计算的。
我看了一些帖子运用分子动力学采用Thermodynamic Integration计算自由能差的(http://simulation.5d6d.net/thread-16047-1-1.html;http://www.pages.drexel.edu/~cfa22/msim/node40.html;http://www.google.com.hk/url?q=http://en.wikipedia.org/wiki/Thermodynamic_integration&sa=U&ei=tk7xUKjnD4qdkgX1uoFg&ved=0CBgQFjAA&usg=AFQjCNEkag1gjZPsg5iTHL_-mIE51SyF8Q),经典分子动力学(有明确的势函数形式)中对于两个体系自由能差的计算是引入一个参数lambda,构建两个体系的合成势函数u = lambda*u2(1-lambda)*u1,也就是对势能函数进行微扰,采用不同的lambda计算的系综平均,然后对lambda在0—1的区间的积分就得到两个体系的自由能差。
但是,第一性原理分子动力学(NVT系综)和准谐近似之间的势函数解析形式是未知的,只能计算得到相应的数值(某个体积和温度下的),无法构建复合势函数u = lambda*u2(1-lambda)*u1(其中u2为文献分子动力学得到相应体积V和温度下的势能,u1为文献采用准谐近似计算得到相应体积V和温度下的势能),而文献中对ambda则采用不同的值进行了计算,不知道他们是如何构建复合势函数的,或者是如何在VASP的分子动力学中设置lambda的?请求指点一下。

唯美之恋 发表于 2018-11-21 11:43:04

还有一篇文献没传完

碎花洋裙的优雅 发表于 2018-11-21 11:43:06

有趣的主题,看看

唯美之恋 发表于 2018-11-21 11:43:22

怎么没人回复啊

萨迪斯 发表于 2018-12-29 17:35:03

00.0.0.0.00.
页: [1]
查看完整版本: 第一性原理分子动力学热力学积分求非谐自由能