饿货不傻 发表于 2018-11-27 16:12:44

关于frcmod参数的问题

我刚学习amber不久，
做的是含有金属离子铂的动力学
现在遇到问题是怎么做frcmod文件？ 还请各位高手指教

黑毛茎长 发表于 2018-11-27 16:12:54

这是网上的添加ZN的教程，按照这个做就行http://structbio.vanderbilt.edu/ ... chive/2004/4188.php，关键要找到金属离子相应的参数

饿货不傻 发表于 2018-11-27 16:13:01

貌似我看有的文献上面金属参数它是自己生成的，或者直接引用这些文献上面的参数可以么？？对于量化，自己也不是很懂，还请高手指教一下，谢谢~~~

一念天堂 发表于 2018-11-27 16:13:32

http://structbio.vanderbilt.edu/ ... chive/2004/4188.php
AMBER Archive (2004)
Subject: RE: AMBER: how to prepare Zn.lib

饿货不傻 发表于 2018-11-27 16:13:54

:handshake
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