一婊人才 发表于 2018-11-27 16:16:47

ANAL module 的问题

Amber 8 Users' Manual
Manual for the (retired) gibbs program
Manual for the (retired) carnal program
Manual for the (retired) anal program
我现在用的amber11想用ANAL module计算ligand 与其周围环境（receptor、solute、water）的总的ELE 和VDW，从而来估算liner interaction energy。amber8以前的版本有ANAL module，amber11没有了。如何来计算呢？amber11有没有替代的模块呀？总不可能版本越新越落伍吧。

南风知我意 发表于 2018-11-27 16:16:59

您说的是不是新版本中的mm-pbsa模块，我现在想用下老版本中的anal模块，不知您方便给一个输入模板吗？谢谢

一婊人才 发表于 2018-11-27 16:17:08

:handshake
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