浅眠未安 发表于 2018-11-27 17:19:33

一个有关AMBER中makeDIST_RST的问题

各位大大好，对于AMBER我是一个新手，最近开始用AMBER做小分子的模拟，下面是我碰到的问题，请高人指点。另外有没有哪位有完整的小分子模拟的例子，先谢谢了.
$ makeDIST_RST -upb MLU2109.upb -pdb ./prep/MLU2109.pdb -rst MLU2109.dist -map map.MLU2109
# makeDIST_RST
Currently configured for up to 5000 atoms
ERROR can't open map file map.MLU2109 for reading

予我心安 发表于 2018-11-27 17:19:41

首先你的原子数是不是超过了5000呢，还有你要找到map.MLU2109这个文件啊
amber自带了很多的教程，多看看就行了~

浅眠未安 发表于 2018-11-27 17:20:10

谢谢      

因帅入狱 发表于 2018-11-27 17:20:29

如果是通过正式申请得到的waive版，我觉得应该是可以发文章的~
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