US for Proton Transfer
Amber 网上给了个用SMD做proton transfer的例子,请教大家用一般的umbrella sampling是怎么做的?Thanks!手册上还提到了EVB的方法,大家都没有用QMMM方法做过umbrella sampling吗? 因为半经验方法对质子描述的都不是很好,所以我认为 Amber 中的 umbrella sampling 不适合模拟质子迁移。 如果是QMMM结合umbrella sampling呢? 我说的半经验方法指的就是QMMM中QM部分使用的方法,Amber 10中目前只能使用半经验的QM方法。
也是刚刚学习 想用umbrella sampling方法 :handshake
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