自欺欺人 发表于 2018-11-28 10:26:11

用nmode算熵算一半断掉,能继续算吗?

如果算一半断掉,能接下去手动继续算吗?
比如已经生成了snapshot_com.all.out, snapshot_rec.all.out 文件,在算lig的熵的时候断掉,怎么继续算呢?如果是手动算,需要用到哪几个命令呢?
比如说手动算这一步 nmode -O -i nmode_com.in -o nmode_com.1.out -c sanmin_com.1.restrt -p ./*.top
那下一步用什么命令可以生成snapshot_lig.all.out 文件,以及snapshot_statistics.out文件?
或者有没有更好的办法?。。。算这个破熵真费时间。。。算一半断掉重来岂不是很郁闷 >_<

失之永失 发表于 2018-11-28 10:26:34

你好!我计算熵出现下面报错
nmode -O -i nmode_rec.in -o nmode_rec.1.out -c sanmin_rec.1.restrt -p ./*.prmtop not running properly
是由于内存不足吗?
那应该怎么改?有人说改 ismem=1这项参数,那这项参数在哪里呢?如果知道能否回复我!谢谢!

自欺欺人 发表于 2018-11-28 10:27:46

:handshake
页: [1]
查看完整版本: 用nmode算熵算一半断掉,能继续算吗?