望誰回眸 发表于 2018-11-28 14:44:32

蛋白SER残基特殊处理

大家好，我模拟的protein-lig体系中，蛋白的SER165残基需要将羟基上的氢原子去掉，但是amber默认的SER的羟基是完整的。
请问有什么办法能生成SER羟基氢原子不存在的蛋白crd文件和top文件的办法吗？

东京樱花 发表于 2018-11-28 14:44:41

只能做一个小分子文件了吧 用antechamber来做

望誰回眸 发表于 2018-11-28 14:44:57

:handshake
页: [1]
查看完整版本: 蛋白SER残基特殊处理