封神 发表于 2018-12-5 17:11:00

如何在pymol分离叠在一起的小分子

想在AUTODOCK 进行蛋白与小分子对接，但是在pymol分离小分子的时候发现pdb中的小分子是两个一样的小分子但是叠加在一起的，请问怎么只取出来一个呢？

晨曦遇晓 发表于 2018-12-5 17:11:15

请问PDB ID是多少，我可以帮你看看。

不可一世 发表于 2018-12-5 17:11:26

（1）直接文本文件打开pdb文件，删掉一个；（2）用其他软件打开，例如ds，可以删掉

封神 发表于 2018-12-5 17:11:35

谢谢         

瞬杀 发表于 2018-12-5 17:50:01

有没有raccon的下载地址呢

瞬杀 发表于 2018-12-5 17:50:31

谢谢分享！我也是刚开始学习，感觉受体文件很难准备，老是报错，好像是说某些氨基酸残基没加氢，不知是什么原因。不知楼主有没有碰到这种情况。希望以后能多交流
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