艺小萌 发表于 2018-12-12 17:21:41

亲爱的,怎样设置水分子势能模型为SPC

亲们,这个对于你们绝对是很简单的问题
我看到有的文献,采用SPC势能函数描述水分子之间的相互作用;
采用Lennard-Jones势能模型描述甲烷分子之间、甲烷分子与水分子之间的相互作用。
这要怎么设置不同分子的势能模型?
因为我是初学者,我一直是认为势能函数是镶嵌在力场中的,你对分子设置不同力场就是设置不同势能函数,看来这是错误的,所以请大神科普一下

艺小萌 发表于 2018-12-12 17:22:06

大神不屑,小菜不会,看样子什么都比发帖学习靠谱

苏小夕 发表于 2018-12-12 17:22:25

我只知道GMX里将水分子模拟例如SPC.itp include 到你的拓扑文件*.top里就行了。就是加上一行:
#include“./SPC.itp”

艺小萌 发表于 2018-12-12 17:22:31

看不懂呀
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