Pymol在选择Ca时 defined with 0 atoms.”怎么办呢?
Pymol在选择Ca时“select carbon, name ca”总显示“Selector: selection "carbon" defined with 0 atoms.”怎么办呢?确定sequence中的name为ca?或者不用输代码,直接在sequence中选择,其为单独的一个sele,然后把该sele重命名为ca,在该sele中进行鼠标操作就可以了 一个蛋白,四百多氨基酸,难不成都一个一个点啊?又没有快选的呢 这个Ca是α碳,不是钙 用word打开pdb,看看pdb中的名字是什么!
ATOM 96CACYS A15 21.565 7.33547.7311.00 21.92 C
ATOM 97C CYS A15 21.715 6.43146.5041.00 21.98 C
ATOM 98O CYS A15 21.085 5.38146.5611.00 22.66 O
ATOM 99CBCYS A15 20.398 8.30247.4681.00 21.17 C
ATOM 100SGCYS A15 20.846 9.58546.2691.00 21.78 S
ATOM 101N ALA A16 22.540 6.75345.4951.00 22.13 N
ATOM 102CAALA A16 22.738 5.97244.2941.00 21.96 C
ATOM 103C ALA A16 21.520 5.21643.8081.00 22.74 C
ATOM 104O ALA A16 21.412 3.98243.8301.00 22.78 O
比如上面的确实是CA,则可以select carbon, name ca或者select atom, name ca,这样都可以选择你需要的α-C,要以pdb中的为准 谢谢!
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