彼岸髅灵 发表于 2019-1-3 17:20:43

关于分析对接结果

请教，
1. 我用auto dock做了酶和我（R）（S）底物对接，我旨在提高（S）立体选择性。该怎么分析两者对接结果？
2. 对接出来的结果，我想测量成键距离，已成键的用DS直接显示距离，那么如果分析出来其他的范德华力并没有成键啊，但我想测下距离，测哪个原子到哪个原子的距离，还是，酶上氨基酸残基最外枝 的原子和最靠近的底物原子的距离？
3. 大神们有没有好看的pymol作图经验，求发一份，上网找了好多，老板觉得并不完美
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