极度嚣张 发表于 2019-1-3 17:28:33

RNA与蛋白分子动力学模拟

想找个朋友交流一下

我现在在这个RNA与蛋白的分子动力学模拟，开始使用gromacs 软件的所有的力场都报错，后面发现RNA这个小分子的原子类型与力场不符合，所以我就改了一
下RNA的pdb文件的原子类型，结果是可以运行的，但是使用vmd和pymol两个软件查看，发现这个修改后的RNA结构变成了一坨了，结构完全都变了。不知道有没有朋友遇到过这个问题，如有知道的，可以回帖，私信或者qq：1509394753，交流一下！谢谢各位。
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