大家好：
  对 对接产生的大量复合物结构，通常是通过聚类的方法得到优势簇，然后结合实验信息进一步进行过滤。。
我的编程能力有限，我的疑问是有没有什么现成的软件进行聚类 ？？
对于protein-prtotein 体系可以用mmtsb，但是对于Protein-nucleic acid ，我就无能为力了。。
感谢大伙支招...

用Discovery Studio可以对ZDock的对接结果进行聚类分析，学术版的也可以做聚类，就是麻烦点，网上有教程，楼主可以跟着一步步的做

DS 免费的吗？？还有 在win下还是liunx平台下可用呢？
另外，Z-Dock 实际上主要用来做Protein-protien 的对接，核酸参数是没有，不过我倒是向作者要过一份，
用Z-Dock 做过protein-RNA对接.. 对这样的体系DS也可以clustering的？？？
要是谁能修改下MMTSB里的source code 使之也可以用来对待非蛋白体系执行 superimpose 和 cluster 就好了。。

DS是商业软件 收费的 Windows下和Linux下都可以用
你既然可以用ZDock做蛋白核酸对接了 那继续按照教程做聚类不可以吗？
我没做过蛋白核酸体系，所以如果不行的话，那是我想当然了，sorry~~