做了一组模拟，分析蛋白的RMSD值，变化挺大，但是分析蛋白内部的氢键，却发现基本处于平衡状态，没太大变化。
想请教各位，结构的变化与氢键的变化有关系吗

范德华力，疏水作用，氢键，静电相互作用是影响蛋白质结构重要的作用力
对同一结构来说，氢供体和氢受体是一定的，在模拟的过程中，氢键的形成也是一个动态平衡的过程
我不知道正确与否，对于同一个结构来说，氢键的数目应该是一定的，处在动态平衡的过程中，但是对于一个结构，如突变前和突变后两种状态，结构上发生变化，两者比较，氢键也有可能发生变化