VMD如何保存pdb文件

本帖最后由要疼你一辈子于 2018-11-23 11:22 编辑

我想把gro转成pdb文件。试过 pdb2gmx -f file.gro -o file.pdb，但系统提示错误，说找不到离子，奇怪了，我的topol.top文件里明明有ions.itp 和离子名称以及个数。如果用命令不好转的话，用VMD如何转？请说得详细一些，谢谢！

显示全部楼层 · 发表于 2018-11-23 11:21:58

本帖最后由我的爱只是你于 2018-11-23 11:23 编辑

editconf -f *.gro -o *.pdb

显示全部楼层 · 发表于 2018-11-23 11:22:08

好的明白了