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作者:站在馨染回忆 发表于 2018-11-26 13:46:22
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使用chem3d和ms制作了一个聚合物,但是生成的pdb文件中,原子序号完全是乱的,1-5-2-10-3-4,相邻的原子编号却可能非常远
导致我使用x2top生成itp文件的时候,本来应该每一个单体形成一个0电荷的集团,现在电荷始终无法正确分配,因为一个集团的原子编号都不挨着
如何解决这个问题?
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发表于 2018-11-26 13:47:17 | 显示全部楼层

linux下可以用sort命令重新排序再输出一下
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发表于 2018-11-26 13:48:10 | 显示全部楼层
楼主你好,我想请问下制作聚合物用什么软件呢?无比感谢
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 楼主| 发表于 2018-11-26 13:48:17 | 显示全部楼层
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