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在使用amber中SMD时，如何定义group以及进行一个角度的拉伸？

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作者：我知道你都知道 发表于 2018-11-27 10:10:35
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各位大牛：
我现在正在尝试amber中的SMD模拟，目的是使蛋白质中的一部分相对于另一部分拉开一个角度，需要定义3个原子群（group），如何定义群（群中原子的个数最多200）？谢谢
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发表于 2018-11-27 10:10:51 | 只看该作者
可以和你交流一下，amber中的SMD的问题吗？谢谢！
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我知道你都知道

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 楼主| 发表于 2018-11-27 10:10:59 | 只看该作者
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