提问
搜索

PDB文件生成inpcrd和prmtop文件

来源：分子模拟  › 倒序浏览
  • 回答数

    3

  • 浏览数

    1635

  • 收藏数

    0

我来回答 发表话题
作者：鸢尾 发表于 2018-11-27 16:34:57
跳转到指定楼层
我做一DNA的PDB，但里面有些残基（还是配合基）Amber本身没有提供他们的力场，听老师说有个网站可以把PDB转化成crd和top文件，大家有人知道网址吗？谢谢大家了！

分享：
举报
回复

使用道具

眉间点砂

该用户从未签到

新手上路

Rank: 1

积分
38
极客币
99
主题
13
帖子
42
注册时间
2018-10-19
在线时间
2 小时
性别
保密
发表于 2018-11-27 16:35:22 | 显示全部楼层
用 chimera 软件就可以
或者在prodrg servicer 网站
回复

使用道具 举报

浪者不回头

该用户从未签到

新手上路

Rank: 1

积分
46
极客币
113
主题
13
帖子
55
注册时间
2018-10-19
在线时间
2 小时
性别
保密
发表于 2018-11-27 16:35:35 | 显示全部楼层
这个得到的是相当于tleap处理过的么
一直用antechamber，回头试试
回复

使用道具 举报

鸢尾

该用户从未签到

中级会员

Rank: 3Rank: 3

积分
500
极客币
103
主题
14
帖子
44
注册时间
2018-10-19
在线时间
3 小时
性别
保密
 楼主| 发表于 2018-11-27 16:36:39 | 显示全部楼层
回复

使用道具 举报

高级模式 评论
您需要登录后才可以回帖 登录 | 立即注册 微信登录
B Color Image Link Quote Code Smilies
Archiver|手机版|小黑屋|极客学术 |京ICP备16066145号-3
Powered by Discuz! X3.4  © 2014-2020 Comsenz Inc.