本人刚开始接触分子对接，想请教大家一个问题，我想做三价Fe、小分子A、蛋白质B之间的三元对接，首先Fe和A要形成络合物C。可以用autodock吗?如果用Autodock可以对接Fe和A形成C，然后C和蛋白质B对接，请大牛们赐教，新手

铁卟啉这样的分子，你可以尝试去下载一个p450酶系列的pdb，然后提取中间的铁卟啉，再去做对接。