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作者:地狱异类 发表于 2018-12-4 17:20:35
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对接成功后如何变为一个pdb 文件?谢!
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 楼主| 发表于 2018-12-4 17:20:54 | 显示全部楼层
autodock 对接成功后如何变为一个pdb 文件?谢!
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发表于 2018-12-4 17:20:56 | 显示全部楼层
对接成功后,加入原来的受体,在“set play options"对话框下选择"write complex"将把“配体+受体”文件保存为.pdbqt格式的文件(若直接保存为pdb格式的,再用其它软件pymol开打是会结构会异常,因为带电荷);将.pdbqt文件再用Autodock打开,再保存File>Save>Write PDB即得到正常结构的对接好的结构了。
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 楼主| 发表于 2018-12-4 17:21:11 | 显示全部楼层
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