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作者:云游四海 发表于 2018-12-5 17:55:58
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在rcsb蛋白数据库下的蛋白,把原配体抠掉,重新用原配体去对接,发现得分不高,是怎么回事,对接能只有-7.9。
求助。
!!!@川太狼

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发表于 2018-12-5 17:56:07 | 显示全部楼层
-7.9为什么叫得分不高呢?那何为得分高呢?
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 楼主| 发表于 2018-12-5 17:56:16 | 显示全部楼层
pdb 网站上面给出的ic50  在几 nmol  ,我接上去autodock的ki只有1umol
,差很多
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发表于 2018-12-5 17:56:23 | 显示全部楼层
这是正常的。如果你要预测活性,那么可以用seesar软件。分子对接软件的ki计算本来就不准确。还不要说是IC50和Ki的比较,对于不同的分子作用机制,Ki和IC50可能是不相关的。
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 楼主| 发表于 2018-12-5 17:56:34 | 显示全部楼层
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