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作者:软肋是你 发表于 2019-1-3 11:45:52
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Pymol在选择Ca时“select carbon, name ca”总显示“Selector: selection "carbon" defined with 0 atoms.”怎么办呢?
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发表于 2019-1-3 11:46:04 | 显示全部楼层
确定sequence中的name为ca?或者不用输代码,直接在sequence中选择,其为单独的一个sele,然后把该sele重命名为ca,在该sele中进行鼠标操作就可以了
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 楼主| 发表于 2019-1-3 11:46:10 | 显示全部楼层
一个蛋白,四百多氨基酸,难不成都一个一个点啊?又没有快选的呢
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 楼主| 发表于 2019-1-3 11:46:27 | 显示全部楼层
这个Ca是α碳,不是钙
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发表于 2019-1-3 11:46:35 | 显示全部楼层
用word打开pdb,看看pdb中的名字是什么!
ATOM     96  CA  CYS A  15      21.565   7.335  47.731  1.00 21.92           C  
ATOM     97  C   CYS A  15      21.715   6.431  46.504  1.00 21.98           C  
ATOM     98  O   CYS A  15      21.085   5.381  46.561  1.00 22.66           O  
ATOM     99  CB  CYS A  15      20.398   8.302  47.468  1.00 21.17           C  
ATOM    100  SG  CYS A  15      20.846   9.585  46.269  1.00 21.78           S  
ATOM    101  N   ALA A  16      22.540   6.753  45.495  1.00 22.13           N  
ATOM    102  CA  ALA A  16      22.738   5.972  44.294  1.00 21.96           C  
ATOM    103  C   ALA A  16      21.520   5.216  43.808  1.00 22.74           C  
ATOM    104  O   ALA A  16      21.412   3.982  43.830  1.00 22.78           O  
比如上面的确实是CA,则可以select carbon, name ca或者select atom, name ca,这样都可以选择你需要的α-C,要以pdb中的为准
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 楼主| 发表于 2019-1-3 11:47:10 | 显示全部楼层
谢谢!
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