对接结果疏水力显示软件

autodock对接结果，pymol和DS无法显示疏水力，使用ligplot作图，发现很多典型的亲水氨基酸如asp arg 也会形成较强疏水作用，是否能根据软件给出的结果做出小分子配体能与asp arg产生疏水作用？

显示全部楼层 · 发表于 2019-1-3 11:47:51

ds可以显示疏水作用

显示全部楼层 · 发表于 2019-1-3 11:48:07

poseview可以做，有在线免费的服务器，但是很慢，所以还是靠pymol好好构思作图，应该没问题的

显示全部楼层 · 发表于 2019-1-3 11:48:15

求带啊

显示全部楼层 · 发表于 2019-1-3 11:48:46

其实主要困惑在于：使用ligplot处理结果，发现很多典型的亲水氨基酸如asp arg 也会形成较强疏水作用，是否正确？

显示全部楼层 · 发表于 2019-1-3 11:49:03

用的DS做的二维平面图，只能做氢键范德华力