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量子化学软件 量子化学——应用量子化学的基本原理和方法研究化学 问题。 基于第一性原理，主要处理体系电子效应相关 分子轨道理论、价键理论、密度泛函理论 研究分子结构、化学反应、分子性质 常见量子化学软件：Gaussian、NWChem、VASP、Q-Chem、 ADF、Turbomole、Molpro、Gamess等。 计算特点：对CPU、内存、IO等需求比较大，大量的集合通信
分子模拟软件 分子模拟——依靠牛顿力学来模拟分子体系的运动 基于经典牛顿方程，不考虑电子效应，应用不同的力场 主要处理大分子体系：动力学行为、宏观性质 考虑不同系综的计算：NPT，NVE，NVT等 常见的分子动力学软件：Gromacs、NAMD、 AMBER、 LAMMPS、Charmm等。 计算特点：对CPU和IO需求较大，大量的点到点通信。
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