我在用DS对接蛋白（如bSA）时，总是对接不上，提示配体有问题。我的配体制作是按照dS操作指南进行的，也有用PDB格式通过Openbabel 转化为ds格式的,请教各位大侠，如何处理？蛋白是两条链以上且活性位点不明确或多个结合位点时如何处理？

我在用DS对接蛋白（如bSA）时，总是对接不上，提示配体有问题。我的配体制作是按照dS操作指南进行的，也有用PDB格式通过Openbabel 转化为ds格式的,请教各位大侠，如何处理？蛋白是两条链以上且活性位点不明确或多个结合位点时如何处理？